В начале 2000-х годов предприниматель был совладельцем и входил в состав руководства ряда ведущих компаний России, в том числе ОАО «Талион», банка «Северный морской путь» (СМП-банк), ФГУП «Росспиртпром», «Газтагеда» и «Трубного металлопроката». В 2004 году стал председателем совета директоров СМП-банка. Двумя годами ранее вместе со своим братом Борисом он также приобрел акции «Международного банка торгового сотрудничества» (МБТС-банк).
В 2008 года Аркадий Ротенберг стал совладельцем компании Kadina Ltd., контролирующей Новороссийский морской торговый порт. Совместно с братом выкупил у корпорации «Газпром» пять строительных компаний («Ленгазспецстрой», «Волгограднефтемаш», «Спецгазремстрой», «Краснодаргазстрой» и «Волгогаз»), которые были объединены в холдинг «Стройгазмонтаж». В январе 2015 году по распоряжению правительства РФ «Стройгазмонтаж» стал единственным подрядчиком по строительству моста через Керченский пролив, а в декабре того же года компания была выбрана единственным подрядчиком «Газпрома» в строительстве объектов газопровода «Сила Сибири».
С 2009 года Ротенберг является учредителем компании «СМП-страхование», с 2010 года — совладельцем компаний «Северный европейский трубный проект» и «Мостотрест». В 2014 году приобрел пакет акций (51%) медиахолдинга «Красный квадрат», который производит телевизионную продукцию для Первого канала. Издание Meduza
связывает интерес компании Ротенберга TPS Avia Holding к аэропорту «Домодедово» с арестом владельца аэропорта Дмитрия Каменщика в 2016 году. В августе 2016 года Аркадий Ротенберг стал соучредителем компании «Национальная газовая группа», а в 2017 году аффилированные с ним компании приобрели активы спортивного комплекса «ВТБ Ледовый дворец».
Аркадий Ротенберг занимает 39-е место в
рейтинге «200 богатейших бизнесменов России 2017» Forbes. Его состояние оценивается в 2,6 млрд долларов. По подсчетам Фонда борьбы с коррупцией, в период с 2011 по 2017 год принадлежащие предпринимателю компании получили госконтракты на общую сумму свыше 1 триллиона рублей.
В 2014 году США и ЕС ввели санкции против Ротенберга. 23 сентября 2014 года Италия наложила арест на его имущество, стоимость которого составляла
30 млн евро.
Аркадий Ротенберг имеет ученую степень доктора педагогических наук, он также является вице-президентом Федерации дзюдо России и председателем совета директоров московского хоккейного клуба «Динамо».